番茄工作法也用了一段时间了，好用的同时也带来了一些问题，比如不按时休息，到时间了不结束，什么事情都想“番茄”一下，达不到预定的目标和番茄数目很焦虑等。用番茄工作法，是为了提高效率，而不是为了用方法而用方法，适合自己，能够使用番茄工作法把事情干完才是最好的。
提高时间管理的水平。没有时间管理时，我不知道我有多少时间花在了工作和学习上；开始时间管理之后，我不知道在工作和学习时是如何分配时间的。番茄工作法不仅可以帮助人解决专注度的问题，还可以将时间分配情况在一定程度上可视化，解决“时间去哪了”的问题，要学会自己给自己设计一个秘书。使用的核心思想，是为了监控自己的时间去处，记录时间花费，更有效的进行时间管理。
在工作和学习的时候。比如，在完成一项工作任务的时候，或者完成一项学习任务的时候。比如整理材料、论文撰写等。
番茄工作法主要用于3个方面。第一，每周代办事件清单并预计每件事情的大致花费时间。第二，将突发任务随时归档，方便管理。第三，在干每一件事时，使用番茄工作法的核心在于统计干这件事情所花费的时间，而不在于用了多少个番茄。
使用番茄工作法时，也需要面对一些问题，比如一个番茄有25分钟，但很多事情的完成并不是25分钟的倍数。又比如，在深入使用之后，番茄工作法能带来的“心流”状态越来越少，在使用时会关注方法本身，我今天用了几个番茄，跟昨天相比怎么样，等等。在刷手机为什么让人上瘾说到了猎物酬赏，但我不能为了用番茄钟而用番茄钟。一个方法好不好，关键不在方法本身，而在于使用方法的人。
在提交任务时，应把任务分为(a)“使用番茄钟”、(b)不使用番茄钟两种任务类型。任务类型为(a)时，严格按照番茄钟的流程走；任务类型为(b)时，使用番茄钟是为了对任务进行计时。
在番茄土豆APP中，提供了两种对结果复盘的方式：番茄复盘和任务复盘。提供了已完成、日平均数、最佳工作日、最佳工作时段等指标，并可以用标签系统对任务和番茄钟进行分类，对时间的去向，展示的还是很清楚的。为了更好的对结果进行复盘，应该做好两点：
任务清单，写好代办任务，并为突发任务预留空间。 标签系统，在番茄的标签系统内分为#科研、#学习、#读书、#写作、#工作、#锻炼、#日常6个标签。#日常和#工作主要收集非固定（临时）任务。