这种情况下只需要在目录下创建.gitkeep文件
批量命令：
可以先查询空目录的位置：find . -type d -empty
查询空目录并批量增加 find . -type d -empty -exec touch {}/.gitkeep \;
后面正常增加提交即可。
git add *
git commit -m "add lost empty files"
git push
